Hämeenlinna

Kaivokatu 16
13100 Hämeenlinna
Y-tunnus: 0499964-0

Puh. +358 3 615 370 Fax. +358 3 682 2039

Espoo

Sinimäentie 10 C
02630 Espoo

Oulu - Huollon toimipiste

Aapistie 7 B
90220 Oulu

Tilaukset, tuotetiedustelut sekä muut tiedustelut: info@immunodiagnostic.fi

Ota yhtettä Tekninen tuki ja huolto
Siirry sisältöön

Korona-NGS data-analyysiratkaisu

NGS Data-analyysiratkaisu helppoon ja nopeaan koronavarianttien tunnistukseen!

Kauttamme Flomics pipeline:

  • Täysin automatisoitu, helppo & nopea ratkaisu
  • Lataa fastq-sekvenssitiedostot pilveen ja käynnistä
  • Korona-varianttiraportit valmiita 30–40 minuutissa
  • SARS-CoV-2 referenssigenomi NC_045512.2
  • Uudet variantit helposti lisättävissä tunnistettaviksi
  • Katso demo data täältä (klikkaa “Log in with demo account”)!
  • GDPR compliant
  • Tunnistaa automaattisesti jo annotoidut koronamuunnokset; UK variant, South-African, Brazilian

 

Usean COVID NGS-amplikonipaneelin tiedot jo valmiiksi integroituna:

  • ARTICnetwork V1, V2 and V3
  • Paragon Genomics SARS-CoV-2 panel and FLEX panel
  • Swift Biosciences amplicon panels SARS-CoV-2 and SNAP SARS-CoV-2 Additional Genome Coverage

 

Lataa esite

 

Fully automated cloud-based solution for SARS-CoV-2 NGS-based testing data analysis

  1. It starts with the FASTQ files as input, directly from the sequencer (Illumina, MGI)
  2. It outputs the complete SARS-CoV-2 genome consensus generated with annotation of the variants present and their interpretation
  3. It also provides quality control and intermediate information that the user can then use for downstream analysis

The pipeline will automatically take your data through the following steps:

  • Quality control
  • Adapter trimming
  • Primer removal (for amplicon data)
  • Viral load calculation
  • Read alignment
  • Variant calling and annotation
  • Strain identification
  • Intuitive reporting

With a few clicks you can transform your raw data into interpretable clinical information that will help manage this pandemic, without the need for bioinformatics expertise – there’s less customization which makes it easier & faster to implement & use.
Flomics’ platform is library kit agnostic – you can use the platform with data generated with Paragon, Swift or even the open-source ARTIC protocol, with the same effort.
Flomics team is always available to take users’ feedback and customize the results based on it
Easy to test – Ask voucher code for free runs for 10 samples, Demo Data available (“Log in with demo account”).

Contact us

 

Valikoimissamme useita vaihtoehtoja koronaviruksen NGS-sekvensointiin, lue lisää täältä!