Swift Biosciences
UUTTA: Normalase – tuote NGS-kirjastojen normalisointiin!
Normalase-kittiä käyttämällä voi kokonaan jättää väliin kirjastojen kvantifioinnin ja mittaamisen ja säästää täten aikaa & sekvensointikuluja. Soveltuu käytettäväksi useiden erilaisten DNA -ja RNA-kirjastokittien kanssa!
NGS kirjastokitit eri sovelluksiin Swift Biosciencesilta. Tehokkaat ja toistettavat tulokset jopa pienestä näytemäärästä. Swift Biosciences tarjoaa kirjastokittejä ja geenipaneeleita etenkin pienelle näytemäärälle, sekä Illuminan että Ion Torrentin laitteille. Tuotteet on suunniteltu mm. koko genomi- ja eksomisekvensointiin sekä epigenetiikan ja metagenomiikan tarpeisiin. Swift Biosciencesin tuotevalikoimasta löytyy myös geenipaneeleita etenkin syöpään ja uutuutena kevään aikana tulossa markkinoille 16S-paneeli metagenomiikkaan. Accel-NGS 2S perheen tuotteet soveltuvat kaksijuosteiselle DNA:lle kuten myös Chip-Seqiin, cfDNA ja FFPE -näytteille.
Esimerkkejä kiteistä:
- 2S Turbo DNA kirjastokitit: monipuolinen & muokattava kustannustehokas ratkaisu moniin applikaatioihin, WGS, WES ym. Mukaan joko single, Combinatorial Dual tai Unique Dual Indeksit (UDIs)
- 2S Hyb DNA -kirjastokitti (soveltuu käytettäväksi Hybridization capture -menetelmien kanssa)
- Methyl- Seq DNA- kirjastokitti epigenetiikkaan & bisulfiittisekvensointi-sovelluksiin. Myös single cell näytteille
- 1S Plus kirjastokitti hajonneille & huonolaatuisille DNA-näytteille (Esim. FFPE)
- Myös oma kirjastokitti PacBiolle; Accel-NGS XL
ACCEL-AMPLICON Paneelit (kittikoko 48 rxn):
- Accel-Amplicon Plus 57G Pan-Cancer Profiling Panel
- Accel-Amplicon Plus Comprehensive TP53 Panel
- Accel-Amplicon Plus BRCA1 And BRCA2 Panel
- Accel-Amplicon Plus BRCA1, BRCA2, and PALB2 Panel
- Accel-Amplicon Plus EGFR Pathway Panel
- Accel-Amplicon Plus Lynch Syndrome Panel
- Accel-Amplicon Plus Lung Cancer Panel
- Accel-Amplicon Plus CFTR PanelAccel-Amplicon Plus Colorectal (CRC) Cancer Panel
- Accel-Amplicon Plus Myeloid Panel
- UUTTA: targetoitu 16S-paneeli!
Paragon Genomics
Paragon Genomicsilta kustannustehokkaat multiplex-PCR-pohjaiset targetoidut amplikonipaneelit, sekä räätälöityinä versioina että valmiina paneeleina. Paragon Genomicsin ratkaisuissa etuna PCR-taustaa puhdistava CleanPlex-teknologia. Toimivuus myös haastaville & matalille input-määrille alkaen 100pg-10ng (cfDNA, FFPE). Harvinaisempien varianttien detektioherkkyys 1%, Paragonin UMI Lung Cancer Paneelissa 0.1%.
Custom-versioon voit sisällyttää 7-20 000 amplikonia yhteen PCR-reaktioon (3h single tube protokolla).
Laajat paneelit soveltuvat esimerkiksi:
- Tumor Mutation Burden (TMB) Profiling
- Early Cancer Detection via Liquid Biopsies (with Molecular barcoding UMI)
- Mitochondrial Disease Testing
- Infectious Disease Research
- Agrigenomics High-Throughput Genotyping
Valmiit paneelit esim. syöpätutkimukseen ja genetiikan laboratorioihin:
- CleanPlex® OncoZoom Panel (65 syöpägeenin ja 2900+ hotspotin paneeli)
- CleanPlex® BRCA1 & BRCA2 Panel
- CleanPlex® TP53 Panel
- CleanPlex® Hereditary Cancer Panel (sis. 37 perinnöllisiin syöpiin assosioituvaa geeniä)
- CleanPlex® UMI Lung Cancer Panel (esim. nestebiopsiatutkimukseen ja diagnostiikkaan)
- CleanPlex® Mitochondrial Disease Panel
- CleanPlex® Myeloid Panel –Coming soon
- Kysy 8 reaktion testikittiä!
LCG Biosearch (Lucigen)
LCG Biosearch (Lucigen) tarjoaa edullisia ja nopeita kirjastokittejä Illuminan laitteille.
NxSeq® AmpFREE Low DNA Library Kit
- PCR-vapaa protokotolla
- Edullinen, nopea 2h, Low input 75ng
- Tuottaa eniten sekvensoitavia DNA-fragmentteja kilpailijoihin verrattuna
NxSeq® UltraLow DNA Library Kit
- Kittikoot: 12rxns & High troughput-versio 96rnxs
- Kustannustehokas & herkkä DNA-kirjastokitti
- input 50pg-75ng, 3h protokolla, sopii moneen applikaatioon
NuGEN
NuGEN tarjoaa ratkaisuja DNAseq, RNAseq, Methyl-Seq sekä kustannustehokas targetoitu genotyyppaus – Any application, any organism!
- Single cell, virusdetektio, Ultra low inputs
- Löydä harvinaisemmatkin transkriptit AnyDeplete-teknologian avulla
- Esim. ribosomaalisen RNA:n tai globiinin depleetio sekä myös depleetion custom-mahdollisuus
- DimerFree kirjastot
- DNA-kirjastokiteissä Unique Dual Indices eli UDIs
Lexogen
Lexogenilla on monipuolisesti tuotteita RNA eristyksestä RNA sekvensointiin. Kirjastokittejä tarjolla koko genomisen RNA:n, mRNA sekvensointiin sekä mRNA ekspressiotason mittaamiseen. RNA sekvensointiin SIRVs (Spike-in RNA Variant Control Mixes).
Whole Transcriptome Library Prep -kitit- Expression Profiling Library Prep -kitit
- RNA Enrichment & Depletion
- cDNA Amplification
- Spike-in RNA kontrollit
Lexogenin verkkosivuilta löydät uusimmat julkaisut tuotteiden alta. Kysy neljän näytteen näytekittejä!
- QuantSeq ja SENSE -kitteihin saatavilla UDI:t eli Unique Dual indices näytteiden tehokkaaseen ja tarkkaan multiplexaukseen ja mahdolliseen index hopping-ilmiön tunnistamiseen sekä UMI:t Universal molecular Identifiers /tags tarkoituksena on tunnistaa mahdollinen PCR-bias kirjastonvalmistuksen aikana.
QuantSeqiin myös kustannustehokas globiininpoisto
Genevia Technologies
Genevia Technologies Oy tarjoaa NGS-datan analyysipalvelua tutkimusorganisaatioille, sairaaloille sekä life science -yrityksille. Genevia räätälöi analyysin aina asiakkaan tarpeisiin, ja he auttavat tulosten tulkinnassa aina tutkimusjulkaisuun tai -raporttiin asti.
Tutustu blogiimme, jossa myös NGS-perusteet blogikirjoitussarja:
