Hämeenlinna

Kaivokatu 16
13100 Hämeenlinna
Y-tunnus: 0499964-0

Puh. +358 3 615 370

Espoo

Sinimäentie 10 C
02630 Espoo

Oulu - Huollon toimipiste

Aapistie 7 B
90220 Oulu

Tilaukset, tuotetiedustelut sekä muut tiedustelut: info@immunodiagnostic.fi

Ota yhtettä Tekninen tuki ja huolto
Siirry sisältöön

NGS data-analyysiratkaisut

NGS-protokollat tuottavat helposti isoja määriä sekvenssidataa, jota voi olla hankala analysoida esim. resurssien tai bioinformatiikan osaamisen puuttuessa. Kauttamme saat tukea myös NGS data-analyysiin, joko kittivalmistajilta tai yhteistyökumppaneiltamme:

RNA-sekvensointidatan analyysi – ratkaisut Lexogenin kittien mukana:

  • QuantSeq 3’mRNAseq-kitin mukana koodit Bluebee pipelineen – Veloitukseton, helppo ekspressioprofilointi & vertailu, lataa fastq-tiedostot ja muutamalla klikkauksella valmis! Hyvin käyttäjäystävällinen.
  • Myös Corall Total-RNAseq kokotranskriptomin data-analyysi on mahdollista tehdä Bluebeessä, sis. UMI resolving työkalun.
  • Lue lisää täältä

Kliiniseen data-analyysiin Varsome Clinical

  • CE-IVD sertifioitu järjestelmä; Varianttien annotaatio, luokittelu ja kliinisen raportin valmistus
  • Yhdistettävissä minkä tahansa NGS-datan kanssa (eksomi, kokogenomi, geenipaneelit)
  • Siirrä helposti FASTQ ja/tai vcf -tiedostot
  • ACMG luokittelu
  • Analyysityökalu yhteydessä online yli 70 tietokantaan, mm.: ClinVar, dbSNP, gnomAD, HPO, MONDO, Ensembl, RefSeq, GWAS, CGD, HGNC, UniGene, Orphanet, CIViC genes, GERP, dbNSFP, COSMIC, IARC TP53, ICGC, Kaviar, DANN scores, CIViC mutations, UniProt variants, UniProt domains, GHR, CPIC, DGV, DECIPHER, ExAC CNVs, ExAC genes, PanelApp, Mondo, PMKB ym.
  • Monipuolinen, kustomoitava filtteröinti
  • Analysointi pilvipalvelussa (Saphetor Sveitsi tai private Google cloud)
  • Mm. Swift Biosciences & Paragon Genomics paneelit valmiiksi integroituna
  • Lue lisää

Korona-NGS-data-analyysi

NGS Data-analyysiratkaisu helppoon ja nopeaan koronavarianttien tunnistukseen! Kauttamme mm. Flomics pipeline. Lue lisää täältä:

Korona-NGS

 

Katso kaikki NGS-ratkaisumme täältä!