Epigenetiikalla tutkitaan geenien toiminnan säätelyä, perinnöllisiä tekijöitä, jotka voivat muuttua ympäristön vaikutuksesta mutta jotka eivät muuta alkuperäistä DNA-sekvenssiä. Epigenetiikan mekanismeja on mm. metylaatio, jossa osa perimästä/DNA:sta on hiljennetty metyyliryhmien avulla.
NGS-ratkaisuja näiden mekanismien tutkimiseen:
- DNA:n metylaatiosekvensointi
- Kokogenomin bisulfiittisekvensointi (WGBS)
- Reduced representation bisulfite sequencing (RRBS)
- Kohdennettu, räätälöitävä bisulfiittisekvensointi (hyb capture paneelit)
- 5-hydroksimetyyliryhmien tutkiminen ja erottelu 5-metylaatiosta (oxBS-Seq)
- Yksittäisten solujen (single-cell) NGS-kirjastot ja metylaatioanalyysi
Räätälöitävä, kohdennettu metylaatioanalyysi:
Daicel Arbor Biosciences paneelit
- myBaits Custom Methyl-Seq kits
- Tunnista ja sekvensoi kiinnostavat kohdealueesi genomista
- Kustannustehokas ratkaisu kokogenominlaajuisen metylaatioanalyysin sijaan
- Hybridization capture menetelmä
- Saatavilla myös täysin valmiina avaimet käteen suunnittelu- ja sekvensointipalveluna!
Tunnista & erottele hydroksimetylaatio:
NuGEN/Tecan Genomics oxBS moduulin avulla
- TrueMethyl® oxBS -tekniikka mahdollistaa kahden eri metylaatiomekanismin, 5-metyylisytosiinin (5mC) ja 5-hydroksimetyylisytosiinin (5hmC) erottelun NGS:n avulla
- 5hydroksimetylaatio on modifioitu emäs, jota ei pysty määrittämään perinteisillä bisulfiittisekvensointitekniikoilla, lue tarkemmin täältä
- Esim. nestebiopsia-analytiikkaan, cell-free DNA-näytteille alkaen 10ng, Ultralow Methyl-Seq with TrueMethyl® oxBS -kitti
- Vaihtoehto kokogenominlaajuiseen metylaatioanalyysiin entsymaattisen fragmentaation & UMI:en kanssa, all-inclusive kitti Ovation® RRBS Methyl-Seq with TrueMethyl® oxBS
- Valitse kumpi sopii sovellukseesi paremmin: Valintaopas
Katso kaikki NGS-ratkaisumme täältä!
