Hämeenlinna

Kaivokatu 16
13100 Hämeenlinna
Y-tunnus: 0499964-0

Puh. +358 3 615 370

Espoo

Sinimäentie 10 C
02630 Espoo

Oulu - Huollon toimipiste

Aapistie 7 B
90220 Oulu

Tilaukset, tuotetiedustelut sekä muut tiedustelut: info@immunodiagnostic.fi

Ota yhtettä Tekninen tuki ja huolto
Siirry sisältöön

Metylaatiosekvensointi

Epigenetiikalla tutkitaan geenien toiminnan säätelyä, perinnöllisiä tekijöitä, jotka voivat muuttua ympäristön vaikutuksesta mutta jotka eivät muuta alkuperäistä DNA-sekvenssiä. Epigenetiikan mekanismeja on mm. metylaatio, jossa osa perimästä/DNA:sta on hiljennetty metyyliryhmien avulla.

NGS-ratkaisuja näiden mekanismien tutkimiseen:

  • DNA:n metylaatiosekvensointi
  • Kokogenomin bisulfiittisekvensointi (WGBS)
  • Reduced representation bisulfite sequencing (RRBS)
  • Kohdennettu, räätälöitävä bisulfiittisekvensointi (hyb capture paneelit)
  • 5-hydroksimetyyliryhmien tutkiminen ja erottelu 5-metylaatiosta (oxBS-Seq)
  • Yksittäisten solujen (single-cell) NGS-kirjastot ja metylaatioanalyysi

Metylaatiosekvensoinnin Gold standard -ratkaisu:

Swift Biosciences Methyl-Seq

Räätälöitävä, kohdennettu metylaatioanalyysi:

Daicel Arbor Biosciences paneelit

Tunnista & erottele hydroksimetylaatio:

NuGEN/Tecan Genomics oxBS moduulin avulla

  • TrueMethyl® oxBS -tekniikka mahdollistaa kahden eri metylaatiomekanismin, 5-metyylisytosiinin (5mC) ja 5-hydroksimetyylisytosiinin (5hmC) erottelun NGS:n avulla
  • 5hydroksimetylaatio on modifioitu emäs, jota ei pysty määrittämään perinteisillä bisulfiittisekvensointitekniikoilla, lue tarkemmin täältä
  • Esim. nestebiopsia-analytiikkaan, cell-free DNA-näytteille alkaen 10ng, Ultralow Methyl-Seq with TrueMethyl® oxBS -kitti
  • Vaihtoehto kokogenominlaajuiseen metylaatioanalyysiin entsymaattisen fragmentaation & UMI:en kanssa, all-inclusive kitti Ovation® RRBS Methyl-Seq with TrueMethyl® oxBS
  • Valitse kumpi sopii sovellukseesi paremmin: Valintaopas

Katso kaikki NGS-ratkaisumme täältä!